• Thursday July 18,2019

Genetische Variation und Evolution der Rinder

Anonim

Es gibt einige Papiere über das Genom der Hauskuh im Moment. ScienceNews hat einen Überblick:

Zwei konkurrierende Forscherteams haben die in der DNA von Rindern gefundene „Essenz der Rasse“ katalogisiert, jedoch in einigen wesentlichen Punkten nicht uneinig.
Online berichteten die beiden Gruppen am 23. April in Science und am 24. April in Genome Biology Entwürfe des Rindergenoms. Dabei wurden Gene identifiziert, die für die Bekämpfung von Krankheiten, die Verdauung von Nahrungsmitteln und die Milchproduktion wichtig sind.

Ich sehe den Genome Biology- Artikel noch nicht auf der Website, aber in Science gibt es zwei. Erstens: Die Genomsequenz von Taurinrindern: Ein Fenster zur Wiederkäuerbiologie und -entwicklung:

Um die Biologie und die Entwicklung von Wiederkäuern zu verstehen, wurde das Rindergenom auf eine etwa siebenfache Abdeckung sequenziert. Das Rindergenom enthält ein Minimum von 22.000 Genen mit einem Kernsatz von 14.345 Orthologen, die von sieben Säugetierarten gemeinsam genutzt werden, von denen 1217 in Nichteutherian-Genomen (Beuteltier- oder Monotrem-Genom) nicht vorhanden sind. Viehspezifische evolutionäre Bruchstellenregionen in Chromosomen haben eine höhere Dichte an segmentalen Duplikationen, eine Anreicherung repetitiver Elemente und speziesspezifische Variationen in Genen, die mit Laktation und Immunreaktion assoziiert sind. Gene, die am Stoffwechsel beteiligt sind, sind im Allgemeinen hoch konserviert, obwohl fünf metabolische Gene deletiert sind oder stark von ihren menschlichen Orthologen abweichen. Die Viehgenomsequenz bietet somit eine Ressource zum Verständnis der Evolution von Säugetieren und zur Beschleunigung der genetischen Verbesserung der Viehbestände für die Milch- und Fleischproduktion.

Dieser Beitrag konzentriert sich auf den umfassenden taxonomischen Kontext von Rindern innerhalb des größeren Stammbaums von Säugetieren und auf die Frage, wie ihr Genom ähnlich bzw. unterschiedlich ist. Orthologe sind nur Gene in verschiedenen Spezies, die vor der Speziation einen gemeinsamen Vorfahren hatten und oft ähnliche Funktionen behalten (wenn auch nicht immer). Sie untersuchen, welche Gene sich in Rindern reorganisiert haben oder einer Selektion unterzogen wurden, und es ist nicht überraschend, dass sie Folgendes feststellt:

Es gibt eine wesentliche Neuorganisation der Genfamilien, die für in der Milch vorhandene Proteine ​​kodieren. Eine solche Umstellung, die die Milchzusammensetzung beeinflusst, umfasst das Histatherin (HSTN) -Gen innerhalb des Casein-Genclusters auf BTA6 (Abb. S21). Im Viehgenom wird HSTN einem für die Expression von β-Casein (CSN2) wichtigen regulatorischen Element (BCE) (23) gegenübergestellt, und als mögliche Folge wird HSTN wie die Casein-Gene während des Laktationszyklus reguliert. Diese Umlagerung, die zur Nebeneinanderstellung von HSTN neben der BCE führte, ist auch die wahrscheinliche Ursache der Deletion einer der beiden Kopien von -S2-ähnlichen Casein-Genen (CSN1S2A), die in anderen Säugetiergenomen vorhanden sind (24). Die biologischen Implikationen dieser Änderung der Anzahl der Kasein-Genkopien sind noch nicht klar.

Das ganze Papier ist eine Buchstabensuppe aus Genen, so dass Sie wahrscheinlich einige Nachlesungen machen möchten. Der zweite Artikel, die genomweite Untersuchung der SNP-Variation, enthüllt die genetische Struktur von Rinderrassen und gibt einen Einblick in die Evolutionsgeschichte von Rindern und die phylogenetische Beziehung verschiedener Rassen:

Die Einprägungen der Domestikation und der Rassenentwicklung auf den Genomen der Tiere unterscheiden sich wahrscheinlich von denen der Haustiere. Eine umfassende Zusammenstellung von Schrotflinten aus einer einzigen weiblichen Hereford-Sequenz und Vergleichssequenzen aus sechs weiteren Rassen wurde zur Entwicklung von Sonden verwendet, um 37.470 Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) bei 497 Rindern von 19 geografisch und biologisch unterschiedlichen Rassen abzufragen. Diese Daten zeigen, dass Rinder in letzter Zeit eine rapide Abnahme der effektiven Populationsgröße einer sehr großen Ahnenpopulation erfahren haben, möglicherweise aufgrund von Engpässen, die mit der Domestikation, Selektion und Rassenbildung zusammenhängen. Domestizierung und künstliche Selektion scheinen im Rindergenom nachweisbare Selektionssignaturen hinterlassen zu haben, jedoch ist das derzeitige Maß an Diversität innerhalb der Rassen mindestens so groß wie im Menschen.

Hier sind die Zahlen von Anmerkung:


Denken Sie daran, dass sich jedes K darauf bezieht, die Gene den K- Populationen zuzuordnen und zu sehen, wie sich die Genome des Individuums ordnen, wenn Sie die Anzahl der K 's erhöhen. Die PC-Charts sind eher selbstverständlich. Bevölkerungen mit allgemeinem Abstieg häufen sich aneinander und so weiter.
Ich habe die Zeitungen schnell durchgelesen, aber ich sah nichts, was mich als zu überraschend ansah. Rinder waren aufgrund von Krankheiten und der Selektion für die Milchproduktion einer Evolution unterworfen. Die aus Indien stammenden Varianten sind in einer anderen Klasse als die anderen Rinder. Eine große Ahnenpopulation scheint einen Engpass erlebt zu haben, wahrscheinlich aufgrund der Domestizierung. Aber selbst wenn es nicht überraschend ist, gehe ich davon aus, dass das Durchpflügen der Organe des Organismus nach dem Organismus einige verwirrende Erwartungen hervorrufen wird.
Wenn Sie die Natur der genetischen Variation von Rindern kennen, kann dies natürlich zu einem "Supercow" führen, wenn Sie den Presseberichten glauben.

.
(Wie es passiert, frage ich mich, ob ein Supercow aufgrund der genetischen Korrelation unmöglich ist.)


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