• Monday June 17,2019

Und sie kamen aus Zentralasien

Anonim

AJHG hat ein neues Papier herausgebracht, Genetische Vielfalt des gesamten Genoms in einer Auswahl von Australiern mit Deep Aboriginal Ancestry, die ich später treffen werde. Es ist nicht zu überraschend, aber in den Beilagen haben sie eine Abbildung, die sowohl Frappe- und Strukturdiagramme für die HGDP-Populationen als auch ihre australische Aborigines-Probe zeigt. Diese Methoden nehmen das Genom eines Individuums und weisen einer K-Ahnenpopulation Elemente zu. Für Afroamerikaner ist dies sehr aufschlussreich, da K = 2 einfach nach europäischen / afrikanischen Abstammungslinien zusammenbricht. Der Mittelwert liegt bei ~ 20% für das Minderheitsquantum, genau das, was zuvor durch Genealogie, klassische autosomale Marker (z. B. Duffy) und den Durchschnitt der uniparentalen Abstammungslinien der europäischen Abstammung (afrikanische Amerikaner) für europäische Herkunft ermittelt wurde Y-Chromosomenmarker und haben weniger als die erwarteten europäischen mtDNA-Marker. Wiederum völlig verständlich im Hinblick auf die Geschichte der Beziehungen im alten Süden.

Diese Abstraktionen extrahieren visuell verständliche Informationen aus den hunderttausenden konkreten variantenbasierten Grundlagen der menschlichen Bevölkerung. Sie haben einen klaren und unmittelbaren Nutzen, wenn Sie eine Ahnung von der Bevölkerungsgeschichte einer bestimmten Probe haben. Aber wenn Sie dasselbe mit Bevölkerungen versuchen, deren Geschichte weniger klar und eindeutig ist oder die keine so offensichtliche und bekannte Genese wie die Afroamerikaner haben, werden die Dinge düsterer.


Wenn es also in vielen dieser Artikel zu höheren Werten für K kommt, lese ich einfach nicht zu viel in die Ergebnisse, da der menschliche Geist eine Mustererkennungsmaschine ist und es sehr einfach ist, Geschichten zu erzählen, die keine Gültigkeit haben oder gefälscht. Die meisten Autoren dieser Arbeiten neigen dazu, zuzustimmen, da in den Ergänzungen höhere K-Diagramme normalerweise nicht in der Hauptarbeit verschachtelt sind. Aber mit all dieser Vorsicht war ich der Meinung, dass K = 8 in der ergänzenden Abbildung 1 von Interesse ist, und ich möchte mich nur ein wenig darauf konzentrieren. Ich wiederholte es erneut, entfernte viele Populationen und verschob die Frappe- und Strukturdiagramme bei K = 8 nebeneinander. Ich habe aus Gründen der Klarheit auch einige Populationsbezeichnungen hinzugefügt. Wenn Sie jedoch mit dem HGDP-Datensatz vertraut sind, ist es klar, was die Abkürzungen sind.

Zunächst scheint es, dass bei K = 8 die Tatsache, dass die nicht-indigene Abstammung der australischen Aborigines-Stichprobe Westeuropäer ist, auch ohne die bekannte Geschichte ziemlich klar ist (Dienekes stellte dies auch fest). Die einzige Frage ist zu unterscheiden, von welchen westeuropäischen Bevölkerungen der Beitrag stammt, und dies ist aufgrund einer möglichen Verbindung zwischen Indien und Australien von Interesse. Viele Südasiaten haben eine vage Ähnlichkeit mit australischen Aborigines, und viele indische Stammesgruppen werden als "Australoid" bezeichnet. In jüngerer Zeit wurde eine sehr weit entfernte mtDNA-Verbindung zwischen indischen Stammesgruppen und Aboriginals bestätigt. Aber das ist völlig erwartet, da wahrscheinlich alle Bevölkerungen im Osten Südasiens diese Region auf dem Weg aus Afrika durchquert haben. Eine Koaleszenzzeit in der Größenordnung von 50.000 Jahren scheint darauf hinzudeuten, dass dies die Verbindung ist und nicht eine neuere Migration, wie einige vermutet haben, und die morphologische Ähnlichkeiten als phylogenetische Kausalgrundlage verwenden könnte.

Beachten Sie im Frappe-Plot rechts, dass die Südasiaten für die orangefarbene Ahnengruppe angereichert sind. Es ist bei den meisten Europäern geblieben und bei australischen Aborigines fast nicht vorhanden. In der Strukturdarstellung links ist es das blaue Segment, das bei Südasiaten angereichert ist und bei Europäern übrig bleibt. Wieder ist es bei Aboriginals fast nicht vorhanden. Zusammen mit dem nachgewiesenen Vorhandensein einer hohen Häufigkeit europäischer Diagnostikmarker, wie den Blue-Eye- OCA2- SNPs, sollte dies den Deal bezüglich der Frage einer neueren Beimischung aus der ursprünglichen Abrechnung des aktuellen indigenen Bestandes mit einem beliebigen besiegeln Gruppe aber Europäer.

Aber der Grund, warum ich poste, liegt nicht an der Aboriginal-Genetik. Es gibt ein paar grobe Gruppen von Menschen. Grob gesagt, Indianer, Ostasiaten, Ozeanier, Westeurasier + Nordafrikaner und Subsahara-Afrikaner. Innerhalb dieser Cluster gibt es jedoch weitere Unterschiede. Bei den Mozabiten (einer algerischen Berbergruppe mit erheblichen Beimischungen aus Afrika südlich der Sahara), den Basken und Sardianern scheint es ein Element zu geben, das fast nicht vorhanden ist, aber mit zunehmender Häufigkeit in Richtung Osten Eurasiens zunimmt. Ich beziehe mich hier auf die oben genannten Segmente, die ich als die Komponenten hervorgehoben habe, deren Mangel darauf hindeutet, dass Aborigines ihre nicht-indigene Abstammung von Europäern erhalten haben.

Ich denke dabei an das Argument von Li et al., Wonach eine verdrehte Bevölkerungsabdeckung dazu geführt hat, dass ein bedeutender zentraler eurasischer Bevölkerungsstamm zwischen denen im Westen und Osten geschlossen wurde. Wenn es einen großen demografischen Impuls außerhalb des Zentrums von Eurasien gibt, wäre es sinnvoll, dass Gruppen am westlichen Rand der Weltinsel, diejenigen im westlichen Mittelmeerraum, das geringste Anzeichen davon haben. Ich habe kein Modell für einen solchen Puls. Vielleicht war es kein Puls, sondern nur eine Isolation durch Entfernung und eine Klinalvariation, die diskret auftaucht, wenn man die K's aufdreht. Mein erster Gedanke ist, dass es sich um die indoeuropäischen Sprachen handelte, aber sie ist in der Levante gut vertreten, und die Adygei (ADY) sind sowieso nicht indoeuropäisch (obwohl sie mit indoeuropäisch weit entfernt sein könnten und so ausstellen einige der gleichen genetischen Variation wie die ursprüngliche Population). Ich denke, es besteht eine gute Chance, dass ich hier die analytischen Methoden Frappe und Struktur mit der Realität verwechsle. Aber ich dachte, ich würde es rausschmeißen, seit ich dieses Muster seit einigen Jahren bemerkt habe.

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